Protein–RNA interactions for Protein: Q16543

CDC37, Hsp90 co-chaperone Cdc37, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC37Q16543 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDC37Q16543 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDC37Q16543 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDC37Q16543 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDC37Q16543 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDC37Q16543 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDC37Q16543 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDC37Q16543 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDC37Q16543 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDC37Q16543 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDC37Q16543 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDC37Q16543 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDC37Q16543 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDC37Q16543 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDC37Q16543 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDC37Q16543 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDC37Q16543 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDC37Q16543 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDC37Q16543 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDC37Q16543 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDC37Q16543 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDC37Q16543 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDC37Q16543 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDC37Q16543 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDC37Q16543 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDC37Q16543 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDC37Q16543 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDC37Q16543 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDC37Q16543 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDC37Q16543 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDC37Q16543 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDC37Q16543 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CDC37Q16543 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDC37Q16543 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDC37Q16543 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDC37Q16543 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CDC37Q16543 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDC37Q16543 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDC37Q16543 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDC37Q16543 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDC37Q16543 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDC37Q16543 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDC37Q16543 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDC37Q16543 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDC37Q16543 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDC37Q16543 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDC37Q16543 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDC37Q16543 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CDC37Q16543 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDC37Q16543 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CDC37Q16543 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDC37Q16543 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDC37Q16543 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDC37Q16543 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDC37Q16543 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDC37Q16543 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDC37Q16543 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDC37Q16543 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDC37Q16543 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDC37Q16543 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDC37Q16543 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDC37Q16543 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDC37Q16543 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDC37Q16543 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDC37Q16543 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDC37Q16543 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDC37Q16543 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDC37Q16543 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDC37Q16543 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDC37Q16543 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDC37Q16543 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CDC37Q16543 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDC37Q16543 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDC37Q16543 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDC37Q16543 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDC37Q16543 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDC37Q16543 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDC37Q16543 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDC37Q16543 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDC37Q16543 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDC37Q16543 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDC37Q16543 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDC37Q16543 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDC37Q16543 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDC37Q16543 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDC37Q16543 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDC37Q16543 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDC37Q16543 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDC37Q16543 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDC37Q16543 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CDC37Q16543 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDC37Q16543 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDC37Q16543 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDC37Q16543 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CDC37Q16543 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CDC37Q16543 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDC37Q16543 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDC37Q16543 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDC37Q16543 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CDC37Q16543 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms