Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ZNF56Q15929 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ZNF56Q15929 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ZNF56Q15929 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ZNF56Q15929 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
ZNF56Q15929 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ZNF56Q15929 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ZNF56Q15929 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ZNF56Q15929 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ZNF56Q15929 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ZNF56Q15929 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
ZNF56Q15929 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ZNF56Q15929 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ZNF56Q15929 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ZNF56Q15929 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ZNF56Q15929 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ZNF56Q15929 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ZNF56Q15929 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ZNF56Q15929 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
ZNF56Q15929 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ZNF56Q15929 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ZNF56Q15929 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ZNF56Q15929 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ZNF56Q15929 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ZNF56Q15929 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ZNF56Q15929 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ZNF56Q15929 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ZNF56Q15929 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ZNF56Q15929 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ZNF56Q15929 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ZNF56Q15929 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ZNF56Q15929 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ZNF56Q15929 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ZNF56Q15929 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ZNF56Q15929 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
ZNF56Q15929 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ZNF56Q15929 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ZNF56Q15929 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ZNF56Q15929 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ZNF56Q15929 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ZNF56Q15929 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ZNF56Q15929 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ZNF56Q15929 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ZNF56Q15929 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ZNF56Q15929 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ZNF56Q15929 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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ZNF56Q15929 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ZNF56Q15929 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZNF56Q15929 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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ZNF56Q15929 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZNF56Q15929 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZNF56Q15929 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZNF56Q15929 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZNF56Q15929 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZNF56Q15929 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZNF56Q15929 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZNF56Q15929 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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ZNF56Q15929 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZNF56Q15929 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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ZNF56Q15929 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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ZNF56Q15929 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZNF56Q15929 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZNF56Q15929 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZNF56Q15929 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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ZNF56Q15929 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZNF56Q15929 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZNF56Q15929 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZNF56Q15929 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZNF56Q15929 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZNF56Q15929 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZNF56Q15929 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZNF56Q15929 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZNF56Q15929 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
ZNF56Q15929 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZNF56Q15929 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZNF56Q15929 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZNF56Q15929 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZNF56Q15929 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZNF56Q15929 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZNF56Q15929 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ZNF56Q15929 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ZNF56Q15929 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
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