Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

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Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
UBE3CQ15386 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
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UBE3CQ15386 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
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UBE3CQ15386 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
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UBE3CQ15386 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
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UBE3CQ15386 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
UBE3CQ15386 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
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