Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
COL4A6Q14031 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
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