Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC22.95■■□□□ 1.27
CNGB1Q14028 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CNGB1Q14028 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
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