Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CAPSQ13938 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms