Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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