Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PDE3BQ13370 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
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