Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRSQ13332 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRSQ13332 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRSQ13332 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRSQ13332 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRSQ13332 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRSQ13332 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRSQ13332 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRSQ13332 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRSQ13332 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRSQ13332 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRSQ13332 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRSQ13332 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRSQ13332 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRSQ13332 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRSQ13332 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRSQ13332 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRSQ13332 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRSQ13332 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRSQ13332 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRSQ13332 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRSQ13332 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRSQ13332 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRSQ13332 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRSQ13332 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTPRSQ13332 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRSQ13332 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRSQ13332 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRSQ13332 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRSQ13332 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRSQ13332 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRSQ13332 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRSQ13332 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRSQ13332 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRSQ13332 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRSQ13332 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRSQ13332 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRSQ13332 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRSQ13332 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRSQ13332 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRSQ13332 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRSQ13332 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRSQ13332 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRSQ13332 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRSQ13332 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRSQ13332 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRSQ13332 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
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PTPRSQ13332 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRSQ13332 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRSQ13332 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRSQ13332 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRSQ13332 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRSQ13332 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRSQ13332 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRSQ13332 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRSQ13332 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRSQ13332 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRSQ13332 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PTPRSQ13332 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRSQ13332 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRSQ13332 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRSQ13332 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRSQ13332 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRSQ13332 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRSQ13332 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
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PTPRSQ13332 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRSQ13332 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRSQ13332 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRSQ13332 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRSQ13332 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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PTPRSQ13332 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRSQ13332 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRSQ13332 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
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PTPRSQ13332 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRSQ13332 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRSQ13332 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRSQ13332 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRSQ13332 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRSQ13332 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
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PTPRSQ13332 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRSQ13332 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRSQ13332 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRSQ13332 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRSQ13332 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRSQ13332 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTPRSQ13332 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRSQ13332 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRSQ13332 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRSQ13332 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRSQ13332 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
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