Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.917e-7■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 PIH1D1-204ENST00000594845 489 ntTSL 520.74■□□□□ 0.917e-7■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 PIH1D1-202ENST00000593629 1084 ntTSL 320.74■□□□□ 0.917e-7■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 PIH1D1-210ENST00000596651 741 ntTSL 320.74■□□□□ 0.917e-7■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 PIH1D1-214ENST00000597577 698 ntTSL 520.74■□□□□ 0.917e-7■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 PIH1D1-215ENST00000598175 418 ntTSL 519.23■□□□□ 0.677e-7■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 PIH1D1-212ENST00000596916 793 ntTSL 519.23■□□□□ 0.677e-7■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.597e-7■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 PIH1D1-219ENST00000600875 633 ntTSL 516.08■□□□□ 0.167e-7■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.392e-8■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.463e-7■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 MRPL15-203ENST00000522521 853 ntTSL 56.86□□□□□ -1.313e-7■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.074e-7■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.322e-7■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 ZNF106-201ENST00000263805 10460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.156e-8■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 RPS27A-205ENST00000463185 590 ntTSL 1 (best)25.24■■□□□ 1.634e-72■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 RPS27A-209ENST00000494756 535 ntTSL 212.88□□□□□ -0.354e-72■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 RPS27A-207ENST00000471772 557 ntTSL 29.47□□□□□ -0.894e-72■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 BAP1-204ENST00000469613 1654 ntTSL 1 (best)20.02■□□□□ 0.86e-7■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.476e-7■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 BAP1-201ENST00000296288 3434 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.536e-7■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 PARK7-210ENST00000497113 670 ntTSL 317.16■□□□□ 0.341e-14■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 TKT-204ENST00000450814 1941 ntTSL 219.72■□□□□ 0.756e-10■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.426e-10■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.196e-10■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 TKT-210ENST00000469678 1871 ntTSL 516.15■□□□□ 0.186e-10■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 ATP5O-208ENST00000491703 2839 ntTSL 215.12■□□□□ 0.016e-10■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 TKT-207ENST00000461139 1972 ntTSL 214.03□□□□□ -0.166e-10■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 TKT-203ENST00000423525 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.176e-10■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 TKT-208ENST00000462138 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.326e-10■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 TKT-206ENST00000460343 7286 ntTSL 212.76□□□□□ -0.376e-10■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 ATP5O-205ENST00000431254 583 ntTSL 211.95□□□□□ -0.56e-10■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 AP000311.1-201ENST00000429238 1078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.56e-10■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 ATP5O-201ENST00000290299 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.516e-10■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.861e-6■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 ALG3-202ENST00000411922 1452 ntTSL 1 (best)20.17■□□□□ 0.821e-6■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.281e-6■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.211e-6■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 PVT1-202ENST00000512617 383 ntTSL 34.06□□□□□ -1.763e-8■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 CMPK1-202ENST00000371871 1212 ntTSL 227.62■■■□□ 2.011e-8■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 CMPK1-201ENST00000371870 812 ntTSL 222.85■■□□□ 1.251e-8■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 CMPK1-204ENST00000450808 950 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.141e-8■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.041e-8■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 SRP54-201ENST00000216774 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.081e-8■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 SRP54-213ENST00000556994 2327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.421e-8■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 SRP54-208ENST00000555557 1949 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.551e-8■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 SERINC1-201ENST00000339697 3137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.631e-8■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 SLC25A39-205ENST00000585636 561 ntTSL 227.44■■□□□ 1.984e-11■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 SLC25A39-206ENST00000585695 1121 ntTSL 227.44■■□□□ 1.984e-11■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 SLC25A39-210ENST00000588315 1409 ntTSL 224.03■■□□□ 1.444e-11■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 SLC25A39-209ENST00000588049 839 ntTSL 523.75■■□□□ 1.394e-11■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 SLC25A39-204ENST00000585523 574 ntTSL 423.75■■□□□ 1.394e-11■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 SLC25A39-208ENST00000586633 566 ntTSL 321.62■■□□□ 1.054e-11■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 SLC25A39-214ENST00000591151 636 ntTSL 217.71■□□□□ 0.434e-11■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 ABCF1-202ENST00000376545 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.546e-9■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 ABCF1-205ENST00000475993 2860 ntTSL 1 (best)11.42□□□□□ -0.586e-9■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 ABCF1-201ENST00000326195 3481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.66e-9■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 RPL11-204ENST00000467075 377 ntTSL 315.05■□□□□ -01e-57■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.972e-10■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.42e-10■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.282e-10■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.212e-10■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.182e-10■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.932e-10■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.872e-10■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.862e-10■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 EEF1D-250ENST00000533833 831 ntTSL 520.16■□□□□ 0.822e-10■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.682e-10■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.362e-10■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 ARHGDIA-205ENST00000579121 637 ntTSL 319.16■□□□□ 0.665e-8■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC31.79■■■□□ 2.684e-15■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 IGF2BP3-201ENST00000258729 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.229e-8■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.752e-6■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.432e-6■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.222e-6■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.892e-6■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.616e-8■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.552e-6■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.142e-9■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 SNRPD2-208ENST00000590212 454 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.465e-19■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 IMPDH2-201ENST00000326739 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.33e-7■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.658e-16■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 RBM3-208ENST00000489344 724 ntTSL 217.19■□□□□ 0.348e-16■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 NPRL3-213ENST00000621703 2812 ntTSL 1 (best)18.13■□□□□ 0.491e-6■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.471e-6■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 NPRL3-214ENST00000622194 2981 ntTSL 517.85■□□□□ 0.451e-6■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.441e-6■■□□□ 12.5
PABPC4Q13310 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.979e-8■■□□□ 12.4
PABPC4Q13310 PDCD2-211ENST00000544336 1164 ntTSL 1 (best)33.62■■■□□ 2.979e-8■■□□□ 12.4
PABPC4Q13310 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.439e-8■■□□□ 12.4
PABPC4Q13310 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.189e-8■■□□□ 12.4
PABPC4Q13310 PDCD2-205ENST00000537445 1114 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.019e-8■■□□□ 12.4
PABPC4Q13310 PDCD2-206ENST00000538195 560 ntTSL 59.52□□□□□ -0.899e-8■■□□□ 12.4
PABPC4Q13310 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.371e-18■■□□□ 12.4
PABPC4Q13310 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.261e-18■■□□□ 12.4
PABPC4Q13310 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.61e-18■■□□□ 12.4
PABPC4Q13310 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.211e-18■■□□□ 12.4
PABPC4Q13310 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.741e-18■■□□□ 12.4
PABPC4Q13310 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.691e-18■■□□□ 12.4
PABPC4Q13310 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.273e-8■■□□□ 12.4
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