Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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FOXF1Q12946 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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FOXF1Q12946 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FOXF1Q12946 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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FOXF1Q12946 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
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FOXF1Q12946 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FOXF1Q12946 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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