Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
STX4Q12846 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
STX4Q12846 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
STX4Q12846 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
STX4Q12846 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
STX4Q12846 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
STX4Q12846 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
STX4Q12846 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
STX4Q12846 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
STX4Q12846 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
STX4Q12846 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
STX4Q12846 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
STX4Q12846 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
STX4Q12846 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
STX4Q12846 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
STX4Q12846 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
STX4Q12846 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
STX4Q12846 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
STX4Q12846 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
STX4Q12846 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
STX4Q12846 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
STX4Q12846 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
STX4Q12846 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
STX4Q12846 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
STX4Q12846 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
STX4Q12846 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
STX4Q12846 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
STX4Q12846 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
STX4Q12846 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
STX4Q12846 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
STX4Q12846 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
STX4Q12846 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
STX4Q12846 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
STX4Q12846 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
STX4Q12846 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
STX4Q12846 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
STX4Q12846 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
STX4Q12846 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
STX4Q12846 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
STX4Q12846 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
STX4Q12846 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
STX4Q12846 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
STX4Q12846 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
STX4Q12846 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
STX4Q12846 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
STX4Q12846 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
STX4Q12846 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
STX4Q12846 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
STX4Q12846 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
STX4Q12846 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
STX4Q12846 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
STX4Q12846 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
STX4Q12846 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
STX4Q12846 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
STX4Q12846 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
STX4Q12846 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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STX4Q12846 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
STX4Q12846 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
STX4Q12846 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
STX4Q12846 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
STX4Q12846 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
STX4Q12846 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
STX4Q12846 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
STX4Q12846 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
STX4Q12846 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
STX4Q12846 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
STX4Q12846 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
STX4Q12846 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
STX4Q12846 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
STX4Q12846 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
STX4Q12846 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
STX4Q12846 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
STX4Q12846 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
STX4Q12846 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
STX4Q12846 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
STX4Q12846 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
STX4Q12846 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
STX4Q12846 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
STX4Q12846 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
STX4Q12846 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
STX4Q12846 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
STX4Q12846 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
STX4Q12846 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
STX4Q12846 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
STX4Q12846 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
STX4Q12846 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
STX4Q12846 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
STX4Q12846 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
STX4Q12846 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
STX4Q12846 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
STX4Q12846 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
STX4Q12846 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
STX4Q12846 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
STX4Q12846 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
STX4Q12846 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
STX4Q12846 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
STX4Q12846 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
STX4Q12846 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
STX4Q12846 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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