Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
GOLGA3Q08378 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GOLGA3Q08378 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GOLGA3Q08378 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GOLGA3Q08378 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GOLGA3Q08378 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
GOLGA3Q08378 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
GOLGA3Q08378 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
GOLGA3Q08378 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GOLGA3Q08378 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GOLGA3Q08378 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GOLGA3Q08378 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GOLGA3Q08378 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GOLGA3Q08378 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GOLGA3Q08378 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GOLGA3Q08378 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GOLGA3Q08378 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GOLGA3Q08378 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GOLGA3Q08378 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GOLGA3Q08378 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GOLGA3Q08378 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GOLGA3Q08378 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GOLGA3Q08378 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
GOLGA3Q08378 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GOLGA3Q08378 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GOLGA3Q08378 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
GOLGA3Q08378 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
GOLGA3Q08378 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GOLGA3Q08378 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GOLGA3Q08378 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GOLGA3Q08378 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GOLGA3Q08378 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GOLGA3Q08378 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GOLGA3Q08378 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GOLGA3Q08378 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
GOLGA3Q08378 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GOLGA3Q08378 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GOLGA3Q08378 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GOLGA3Q08378 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GOLGA3Q08378 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GOLGA3Q08378 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GOLGA3Q08378 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GOLGA3Q08378 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GOLGA3Q08378 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GOLGA3Q08378 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GOLGA3Q08378 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GOLGA3Q08378 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GOLGA3Q08378 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GOLGA3Q08378 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GOLGA3Q08378 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GOLGA3Q08378 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GOLGA3Q08378 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GOLGA3Q08378 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GOLGA3Q08378 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GOLGA3Q08378 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GOLGA3Q08378 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GOLGA3Q08378 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GOLGA3Q08378 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GOLGA3Q08378 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GOLGA3Q08378 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GOLGA3Q08378 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GOLGA3Q08378 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GOLGA3Q08378 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GOLGA3Q08378 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GOLGA3Q08378 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GOLGA3Q08378 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
GOLGA3Q08378 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
GOLGA3Q08378 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GOLGA3Q08378 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GOLGA3Q08378 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GOLGA3Q08378 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GOLGA3Q08378 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GOLGA3Q08378 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GOLGA3Q08378 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GOLGA3Q08378 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GOLGA3Q08378 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
GOLGA3Q08378 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GOLGA3Q08378 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GOLGA3Q08378 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GOLGA3Q08378 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GOLGA3Q08378 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GOLGA3Q08378 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GOLGA3Q08378 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GOLGA3Q08378 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GOLGA3Q08378 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GOLGA3Q08378 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GOLGA3Q08378 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GOLGA3Q08378 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GOLGA3Q08378 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
GOLGA3Q08378 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
GOLGA3Q08378 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GOLGA3Q08378 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GOLGA3Q08378 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
GOLGA3Q08378 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
GOLGA3Q08378 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GOLGA3Q08378 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GOLGA3Q08378 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GOLGA3Q08378 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GOLGA3Q08378 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GOLGA3Q08378 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms