Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLCB3Q01970 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms