Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
EFNB1P98172 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
EFNB1P98172 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
EFNB1P98172 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
EFNB1P98172 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
EFNB1P98172 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
EFNB1P98172 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
EFNB1P98172 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
EFNB1P98172 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
EFNB1P98172 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
EFNB1P98172 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
EFNB1P98172 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
EFNB1P98172 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
EFNB1P98172 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
EFNB1P98172 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
EFNB1P98172 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
EFNB1P98172 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
EFNB1P98172 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
EFNB1P98172 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
EFNB1P98172 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
EFNB1P98172 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
EFNB1P98172 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
EFNB1P98172 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
EFNB1P98172 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
EFNB1P98172 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
EFNB1P98172 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
EFNB1P98172 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
EFNB1P98172 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
EFNB1P98172 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
EFNB1P98172 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
EFNB1P98172 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
EFNB1P98172 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
EFNB1P98172 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
EFNB1P98172 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
EFNB1P98172 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EFNB1P98172 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
EFNB1P98172 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
EFNB1P98172 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EFNB1P98172 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EFNB1P98172 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
EFNB1P98172 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EFNB1P98172 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EFNB1P98172 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
EFNB1P98172 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
EFNB1P98172 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
EFNB1P98172 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EFNB1P98172 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EFNB1P98172 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EFNB1P98172 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EFNB1P98172 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
EFNB1P98172 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EFNB1P98172 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
EFNB1P98172 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
EFNB1P98172 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
EFNB1P98172 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EFNB1P98172 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
EFNB1P98172 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
EFNB1P98172 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
EFNB1P98172 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
EFNB1P98172 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
EFNB1P98172 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
EFNB1P98172 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EFNB1P98172 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EFNB1P98172 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
EFNB1P98172 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EFNB1P98172 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EFNB1P98172 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EFNB1P98172 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EFNB1P98172 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
EFNB1P98172 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EFNB1P98172 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EFNB1P98172 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
EFNB1P98172 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EFNB1P98172 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
EFNB1P98172 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EFNB1P98172 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
EFNB1P98172 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
EFNB1P98172 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
EFNB1P98172 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EFNB1P98172 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
EFNB1P98172 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EFNB1P98172 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
EFNB1P98172 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
EFNB1P98172 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
EFNB1P98172 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EFNB1P98172 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
EFNB1P98172 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
EFNB1P98172 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EFNB1P98172 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
EFNB1P98172 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EFNB1P98172 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
EFNB1P98172 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
EFNB1P98172 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
EFNB1P98172 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
EFNB1P98172 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
EFNB1P98172 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
EFNB1P98172 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
EFNB1P98172 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
EFNB1P98172 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
EFNB1P98172 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
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