Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VLDLRP98155 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms