Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
RPS29P62273 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
RPS29P62273 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
RPS29P62273 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
RPS29P62273 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
RPS29P62273 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
RPS29P62273 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
RPS29P62273 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
RPS29P62273 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
RPS29P62273 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
RPS29P62273 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
RPS29P62273 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
RPS29P62273 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
RPS29P62273 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
RPS29P62273 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
RPS29P62273 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
RPS29P62273 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
RPS29P62273 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
RPS29P62273 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
RPS29P62273 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
RPS29P62273 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
RPS29P62273 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
RPS29P62273 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
RPS29P62273 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
RPS29P62273 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
RPS29P62273 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
RPS29P62273 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
RPS29P62273 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
RPS29P62273 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
RPS29P62273 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
RPS29P62273 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
RPS29P62273 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
RPS29P62273 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC9.36□□□□□ -0.91
RPS29P62273 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
RPS29P62273 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
RPS29P62273 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
RPS29P62273 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
RPS29P62273 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC9.36□□□□□ -0.91
RPS29P62273 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
RPS29P62273 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
RPS29P62273 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC9.36□□□□□ -0.91
RPS29P62273 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
RPS29P62273 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
RPS29P62273 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
RPS29P62273 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
RPS29P62273 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
RPS29P62273 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
RPS29P62273 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
RPS29P62273 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
RPS29P62273 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
RPS29P62273 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
RPS29P62273 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
RPS29P62273 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
RPS29P62273 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
RPS29P62273 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
RPS29P62273 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
RPS29P62273 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
RPS29P62273 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
RPS29P62273 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
RPS29P62273 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
RPS29P62273 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
RPS29P62273 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
RPS29P62273 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
RPS29P62273 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
RPS29P62273 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
RPS29P62273 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
RPS29P62273 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
RPS29P62273 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
RPS29P62273 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
RPS29P62273 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
RPS29P62273 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
RPS29P62273 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
RPS29P62273 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
RPS29P62273 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
RPS29P62273 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
RPS29P62273 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
RPS29P62273 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
RPS29P62273 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
RPS29P62273 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
RPS29P62273 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
RPS29P62273 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
RPS29P62273 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
RPS29P62273 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
RPS29P62273 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
RPS29P62273 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
RPS29P62273 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
RPS29P62273 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
RPS29P62273 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
RPS29P62273 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
RPS29P62273 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
RPS29P62273 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
RPS29P62273 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
RPS29P62273 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
RPS29P62273 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
RPS29P62273 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
RPS29P62273 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
RPS29P62273 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
RPS29P62273 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
RPS29P62273 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
RPS29P62273 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms