Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms