Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms