Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJA9P57773 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJA9P57773 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GJA9P57773 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJA9P57773 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJA9P57773 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJA9P57773 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJA9P57773 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJA9P57773 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJA9P57773 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJA9P57773 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJA9P57773 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJA9P57773 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJA9P57773 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJA9P57773 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJA9P57773 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJA9P57773 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJA9P57773 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GJA9P57773 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJA9P57773 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJA9P57773 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJA9P57773 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJA9P57773 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJA9P57773 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJA9P57773 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJA9P57773 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJA9P57773 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJA9P57773 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJA9P57773 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJA9P57773 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GJA9P57773 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJA9P57773 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJA9P57773 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJA9P57773 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJA9P57773 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJA9P57773 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJA9P57773 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJA9P57773 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJA9P57773 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJA9P57773 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJA9P57773 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJA9P57773 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJA9P57773 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GJA9P57773 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJA9P57773 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GJA9P57773 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJA9P57773 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJA9P57773 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJA9P57773 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJA9P57773 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJA9P57773 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GJA9P57773 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJA9P57773 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJA9P57773 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJA9P57773 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GJA9P57773 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJA9P57773 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJA9P57773 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GJA9P57773 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJA9P57773 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJA9P57773 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GJA9P57773 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GJA9P57773 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJA9P57773 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJA9P57773 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJA9P57773 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJA9P57773 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJA9P57773 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJA9P57773 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GJA9P57773 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJA9P57773 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJA9P57773 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJA9P57773 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJA9P57773 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJA9P57773 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJA9P57773 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJA9P57773 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJA9P57773 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJA9P57773 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJA9P57773 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJA9P57773 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJA9P57773 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJA9P57773 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJA9P57773 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJA9P57773 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJA9P57773 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GJA9P57773 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GJA9P57773 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJA9P57773 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GJA9P57773 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJA9P57773 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJA9P57773 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJA9P57773 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJA9P57773 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJA9P57773 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJA9P57773 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJA9P57773 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJA9P57773 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJA9P57773 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJA9P57773 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms