Protein–RNA interactions for Protein: P53675

CLTCL1, Clathrin heavy chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCL1P53675 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLTCL1P53675 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLTCL1P53675 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLTCL1P53675 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLTCL1P53675 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLTCL1P53675 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLTCL1P53675 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLTCL1P53675 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLTCL1P53675 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLTCL1P53675 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLTCL1P53675 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLTCL1P53675 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLTCL1P53675 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLTCL1P53675 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLTCL1P53675 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLTCL1P53675 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLTCL1P53675 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLTCL1P53675 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLTCL1P53675 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLTCL1P53675 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLTCL1P53675 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLTCL1P53675 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLTCL1P53675 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLTCL1P53675 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLTCL1P53675 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLTCL1P53675 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLTCL1P53675 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLTCL1P53675 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLTCL1P53675 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLTCL1P53675 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLTCL1P53675 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLTCL1P53675 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLTCL1P53675 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLTCL1P53675 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLTCL1P53675 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLTCL1P53675 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLTCL1P53675 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLTCL1P53675 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLTCL1P53675 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLTCL1P53675 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLTCL1P53675 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLTCL1P53675 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLTCL1P53675 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLTCL1P53675 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLTCL1P53675 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLTCL1P53675 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLTCL1P53675 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLTCL1P53675 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CLTCL1P53675 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLTCL1P53675 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CLTCL1P53675 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CLTCL1P53675 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLTCL1P53675 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLTCL1P53675 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLTCL1P53675 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CLTCL1P53675 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLTCL1P53675 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLTCL1P53675 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLTCL1P53675 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLTCL1P53675 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLTCL1P53675 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLTCL1P53675 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLTCL1P53675 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLTCL1P53675 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLTCL1P53675 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLTCL1P53675 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLTCL1P53675 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLTCL1P53675 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLTCL1P53675 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLTCL1P53675 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLTCL1P53675 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLTCL1P53675 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLTCL1P53675 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLTCL1P53675 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLTCL1P53675 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLTCL1P53675 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLTCL1P53675 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLTCL1P53675 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLTCL1P53675 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLTCL1P53675 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLTCL1P53675 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLTCL1P53675 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLTCL1P53675 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CLTCL1P53675 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLTCL1P53675 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLTCL1P53675 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLTCL1P53675 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLTCL1P53675 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLTCL1P53675 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLTCL1P53675 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLTCL1P53675 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLTCL1P53675 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLTCL1P53675 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLTCL1P53675 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLTCL1P53675 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLTCL1P53675 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLTCL1P53675 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLTCL1P53675 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLTCL1P53675 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLTCL1P53675 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms