Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2A2P52657 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms