Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 SRSF5-205ENST00000553635 1412 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 PSMC1P2-201ENST00000423961 1204 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 AC090971.1-201ENST00000559302 510 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 H3F3A-201ENST00000366813 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 RTN1-203ENST00000395090 1609 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 CSNK1A1-209ENST00000606299 1075 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 METTL15-210ENST00000634721 1182 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms