Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FNTBP49356 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FNTBP49356 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FNTBP49356 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FNTBP49356 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FNTBP49356 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FNTBP49356 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FNTBP49356 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FNTBP49356 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FNTBP49356 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FNTBP49356 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FNTBP49356 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FNTBP49356 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FNTBP49356 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FNTBP49356 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FNTBP49356 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FNTBP49356 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FNTBP49356 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FNTBP49356 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FNTBP49356 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FNTBP49356 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FNTBP49356 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FNTBP49356 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FNTBP49356 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FNTBP49356 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FNTBP49356 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FNTBP49356 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FNTBP49356 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FNTBP49356 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FNTBP49356 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FNTBP49356 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FNTBP49356 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
FNTBP49356 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
FNTBP49356 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
FNTBP49356 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FNTBP49356 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FNTBP49356 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FNTBP49356 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FNTBP49356 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FNTBP49356 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FNTBP49356 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FNTBP49356 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FNTBP49356 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FNTBP49356 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FNTBP49356 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FNTBP49356 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FNTBP49356 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FNTBP49356 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FNTBP49356 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FNTBP49356 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FNTBP49356 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FNTBP49356 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FNTBP49356 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FNTBP49356 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FNTBP49356 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FNTBP49356 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FNTBP49356 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FNTBP49356 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FNTBP49356 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FNTBP49356 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FNTBP49356 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FNTBP49356 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FNTBP49356 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FNTBP49356 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FNTBP49356 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FNTBP49356 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FNTBP49356 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FNTBP49356 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FNTBP49356 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FNTBP49356 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FNTBP49356 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FNTBP49356 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FNTBP49356 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FNTBP49356 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FNTBP49356 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FNTBP49356 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FNTBP49356 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FNTBP49356 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FNTBP49356 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FNTBP49356 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FNTBP49356 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FNTBP49356 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FNTBP49356 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FNTBP49356 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FNTBP49356 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FNTBP49356 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FNTBP49356 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FNTBP49356 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FNTBP49356 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FNTBP49356 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FNTBP49356 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FNTBP49356 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FNTBP49356 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FNTBP49356 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FNTBP49356 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FNTBP49356 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FNTBP49356 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FNTBP49356 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FNTBP49356 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FNTBP49356 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms