Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GNPDA1P46926 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.2 ms