Protein–RNA interactions for Protein: P46094

XCR1, Chemokine XC receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCR1P46094 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
XCR1P46094 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
XCR1P46094 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
XCR1P46094 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
XCR1P46094 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
XCR1P46094 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
XCR1P46094 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
XCR1P46094 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
XCR1P46094 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
XCR1P46094 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
XCR1P46094 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
XCR1P46094 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
XCR1P46094 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
XCR1P46094 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
XCR1P46094 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
XCR1P46094 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
XCR1P46094 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
XCR1P46094 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
XCR1P46094 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
XCR1P46094 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
XCR1P46094 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
XCR1P46094 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
XCR1P46094 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
XCR1P46094 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
XCR1P46094 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
XCR1P46094 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
XCR1P46094 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
XCR1P46094 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
XCR1P46094 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
XCR1P46094 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
XCR1P46094 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
XCR1P46094 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
XCR1P46094 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
XCR1P46094 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
XCR1P46094 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
XCR1P46094 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
XCR1P46094 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
XCR1P46094 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
XCR1P46094 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
XCR1P46094 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
XCR1P46094 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
XCR1P46094 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
XCR1P46094 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
XCR1P46094 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
XCR1P46094 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
XCR1P46094 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
XCR1P46094 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
XCR1P46094 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
XCR1P46094 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
XCR1P46094 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
XCR1P46094 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
XCR1P46094 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
XCR1P46094 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
XCR1P46094 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
XCR1P46094 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
XCR1P46094 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
XCR1P46094 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
XCR1P46094 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
XCR1P46094 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
XCR1P46094 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
XCR1P46094 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
XCR1P46094 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
XCR1P46094 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
XCR1P46094 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
XCR1P46094 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
XCR1P46094 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
XCR1P46094 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
XCR1P46094 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
XCR1P46094 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
XCR1P46094 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
XCR1P46094 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
XCR1P46094 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
XCR1P46094 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
XCR1P46094 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
XCR1P46094 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
XCR1P46094 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
XCR1P46094 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
XCR1P46094 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
XCR1P46094 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
XCR1P46094 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
XCR1P46094 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
XCR1P46094 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
XCR1P46094 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
XCR1P46094 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
XCR1P46094 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
XCR1P46094 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
XCR1P46094 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
XCR1P46094 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
XCR1P46094 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
XCR1P46094 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
XCR1P46094 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
XCR1P46094 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
XCR1P46094 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
XCR1P46094 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
XCR1P46094 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
XCR1P46094 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
XCR1P46094 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
XCR1P46094 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
XCR1P46094 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
XCR1P46094 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms