Protein–RNA interactions for Protein: P32455

GBP1, Guanylate-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP1P32455 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GBP1P32455 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GBP1P32455 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GBP1P32455 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GBP1P32455 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GBP1P32455 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GBP1P32455 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GBP1P32455 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GBP1P32455 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GBP1P32455 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GBP1P32455 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GBP1P32455 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GBP1P32455 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GBP1P32455 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GBP1P32455 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GBP1P32455 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GBP1P32455 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GBP1P32455 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GBP1P32455 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GBP1P32455 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GBP1P32455 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GBP1P32455 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GBP1P32455 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GBP1P32455 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GBP1P32455 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GBP1P32455 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GBP1P32455 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GBP1P32455 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GBP1P32455 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GBP1P32455 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GBP1P32455 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GBP1P32455 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GBP1P32455 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GBP1P32455 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GBP1P32455 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GBP1P32455 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GBP1P32455 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GBP1P32455 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GBP1P32455 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GBP1P32455 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GBP1P32455 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GBP1P32455 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GBP1P32455 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GBP1P32455 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GBP1P32455 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GBP1P32455 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GBP1P32455 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GBP1P32455 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GBP1P32455 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GBP1P32455 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GBP1P32455 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GBP1P32455 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GBP1P32455 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GBP1P32455 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GBP1P32455 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GBP1P32455 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GBP1P32455 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GBP1P32455 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GBP1P32455 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GBP1P32455 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GBP1P32455 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GBP1P32455 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GBP1P32455 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GBP1P32455 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GBP1P32455 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GBP1P32455 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GBP1P32455 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GBP1P32455 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GBP1P32455 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GBP1P32455 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GBP1P32455 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GBP1P32455 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GBP1P32455 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GBP1P32455 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GBP1P32455 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GBP1P32455 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GBP1P32455 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GBP1P32455 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GBP1P32455 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GBP1P32455 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GBP1P32455 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GBP1P32455 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GBP1P32455 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GBP1P32455 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GBP1P32455 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GBP1P32455 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GBP1P32455 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GBP1P32455 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GBP1P32455 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GBP1P32455 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GBP1P32455 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GBP1P32455 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GBP1P32455 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GBP1P32455 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GBP1P32455 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GBP1P32455 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GBP1P32455 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GBP1P32455 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GBP1P32455 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GBP1P32455 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms