Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXA7P31268 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXA7P31268 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms