Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CLIP1P30622 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLIP1P30622 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms