Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD40LGP29965 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CD40LGP29965 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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