Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms