Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
IL3RAP26951 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms