Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP2A2P16615 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP2A2P16615 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP2A2P16615 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP2A2P16615 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP2A2P16615 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP2A2P16615 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP2A2P16615 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP2A2P16615 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATP2A2P16615 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2A2P16615 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2A2P16615 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2A2P16615 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2A2P16615 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2A2P16615 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2A2P16615 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2A2P16615 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2A2P16615 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2A2P16615 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2A2P16615 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2A2P16615 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2A2P16615 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2A2P16615 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2A2P16615 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2A2P16615 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2A2P16615 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2A2P16615 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2A2P16615 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2A2P16615 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2A2P16615 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2A2P16615 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2A2P16615 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2A2P16615 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2A2P16615 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2A2P16615 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2A2P16615 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2A2P16615 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2A2P16615 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2A2P16615 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2A2P16615 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2A2P16615 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2A2P16615 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2A2P16615 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2A2P16615 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2A2P16615 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2A2P16615 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2A2P16615 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2A2P16615 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATP2A2P16615 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP2A2P16615 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP2A2P16615 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP2A2P16615 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP2A2P16615 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP2A2P16615 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP2A2P16615 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP2A2P16615 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP2A2P16615 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP2A2P16615 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP2A2P16615 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP2A2P16615 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP2A2P16615 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP2A2P16615 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP2A2P16615 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP2A2P16615 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP2A2P16615 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP2A2P16615 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP2A2P16615 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP2A2P16615 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP2A2P16615 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP2A2P16615 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP2A2P16615 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP2A2P16615 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP2A2P16615 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP2A2P16615 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP2A2P16615 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP2A2P16615 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP2A2P16615 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATP2A2P16615 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP2A2P16615 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms