Protein–RNA interactions for Protein: P13688

CEACAM1, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM1P13688 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CEACAM1P13688 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms