Protein–RNA interactions for Protein: P12955

PEPD, Xaa-Pro dipeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEPDP12955 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEPDP12955 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEPDP12955 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEPDP12955 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEPDP12955 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEPDP12955 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEPDP12955 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEPDP12955 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEPDP12955 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEPDP12955 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEPDP12955 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEPDP12955 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEPDP12955 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEPDP12955 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEPDP12955 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEPDP12955 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEPDP12955 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEPDP12955 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEPDP12955 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEPDP12955 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEPDP12955 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PEPDP12955 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEPDP12955 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEPDP12955 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEPDP12955 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEPDP12955 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEPDP12955 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEPDP12955 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEPDP12955 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEPDP12955 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEPDP12955 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEPDP12955 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEPDP12955 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEPDP12955 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEPDP12955 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEPDP12955 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEPDP12955 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PEPDP12955 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEPDP12955 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEPDP12955 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PEPDP12955 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEPDP12955 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEPDP12955 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEPDP12955 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEPDP12955 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEPDP12955 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEPDP12955 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEPDP12955 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEPDP12955 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEPDP12955 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEPDP12955 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEPDP12955 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEPDP12955 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEPDP12955 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEPDP12955 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEPDP12955 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEPDP12955 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEPDP12955 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEPDP12955 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEPDP12955 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEPDP12955 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEPDP12955 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEPDP12955 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEPDP12955 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEPDP12955 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEPDP12955 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEPDP12955 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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PEPDP12955 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEPDP12955 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEPDP12955 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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PEPDP12955 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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PEPDP12955 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEPDP12955 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEPDP12955 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEPDP12955 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEPDP12955 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEPDP12955 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEPDP12955 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEPDP12955 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEPDP12955 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEPDP12955 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEPDP12955 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PEPDP12955 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEPDP12955 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEPDP12955 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEPDP12955 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEPDP12955 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEPDP12955 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEPDP12955 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEPDP12955 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEPDP12955 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEPDP12955 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PEPDP12955 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEPDP12955 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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