Protein–RNA interactions for Protein: O94888

UBXN7, UBX domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7O94888 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
UBXN7O94888 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms