Protein–RNA interactions for Protein: O94813

SLIT2, Slit homolog 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIT2O94813 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLIT2O94813 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLIT2O94813 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLIT2O94813 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLIT2O94813 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLIT2O94813 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLIT2O94813 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLIT2O94813 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLIT2O94813 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLIT2O94813 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SLIT2O94813 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLIT2O94813 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SLIT2O94813 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLIT2O94813 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLIT2O94813 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLIT2O94813 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLIT2O94813 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLIT2O94813 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLIT2O94813 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLIT2O94813 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLIT2O94813 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLIT2O94813 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLIT2O94813 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLIT2O94813 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLIT2O94813 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLIT2O94813 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLIT2O94813 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLIT2O94813 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLIT2O94813 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLIT2O94813 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLIT2O94813 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLIT2O94813 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLIT2O94813 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLIT2O94813 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLIT2O94813 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLIT2O94813 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SLIT2O94813 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SLIT2O94813 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLIT2O94813 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLIT2O94813 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SLIT2O94813 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLIT2O94813 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SLIT2O94813 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLIT2O94813 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLIT2O94813 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SLIT2O94813 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SLIT2O94813 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLIT2O94813 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLIT2O94813 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLIT2O94813 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLIT2O94813 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLIT2O94813 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SLIT2O94813 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLIT2O94813 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLIT2O94813 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLIT2O94813 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLIT2O94813 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLIT2O94813 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLIT2O94813 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLIT2O94813 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLIT2O94813 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLIT2O94813 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLIT2O94813 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLIT2O94813 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLIT2O94813 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLIT2O94813 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLIT2O94813 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLIT2O94813 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SLIT2O94813 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLIT2O94813 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLIT2O94813 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLIT2O94813 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SLIT2O94813 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SLIT2O94813 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SLIT2O94813 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLIT2O94813 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLIT2O94813 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SLIT2O94813 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLIT2O94813 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLIT2O94813 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLIT2O94813 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLIT2O94813 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLIT2O94813 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLIT2O94813 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLIT2O94813 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLIT2O94813 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLIT2O94813 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLIT2O94813 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLIT2O94813 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLIT2O94813 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SLIT2O94813 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLIT2O94813 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLIT2O94813 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLIT2O94813 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLIT2O94813 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLIT2O94813 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
SLIT2O94813 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLIT2O94813 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLIT2O94813 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
SLIT2O94813 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
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