Protein–RNA interactions for Protein: O60682

MSC, Musculin, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSCO60682 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MSCO60682 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MSCO60682 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MSCO60682 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MSCO60682 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MSCO60682 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MSCO60682 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MSCO60682 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MSCO60682 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MSCO60682 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MSCO60682 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MSCO60682 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MSCO60682 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MSCO60682 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MSCO60682 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MSCO60682 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MSCO60682 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MSCO60682 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MSCO60682 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MSCO60682 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MSCO60682 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MSCO60682 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MSCO60682 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MSCO60682 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MSCO60682 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MSCO60682 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MSCO60682 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MSCO60682 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MSCO60682 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MSCO60682 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MSCO60682 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MSCO60682 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MSCO60682 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MSCO60682 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MSCO60682 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MSCO60682 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MSCO60682 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MSCO60682 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MSCO60682 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MSCO60682 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MSCO60682 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MSCO60682 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MSCO60682 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MSCO60682 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MSCO60682 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MSCO60682 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MSCO60682 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MSCO60682 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MSCO60682 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MSCO60682 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MSCO60682 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MSCO60682 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MSCO60682 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MSCO60682 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MSCO60682 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MSCO60682 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MSCO60682 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MSCO60682 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MSCO60682 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MSCO60682 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MSCO60682 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MSCO60682 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MSCO60682 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MSCO60682 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MSCO60682 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MSCO60682 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MSCO60682 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MSCO60682 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MSCO60682 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MSCO60682 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MSCO60682 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MSCO60682 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MSCO60682 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MSCO60682 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MSCO60682 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MSCO60682 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MSCO60682 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MSCO60682 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MSCO60682 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MSCO60682 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MSCO60682 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MSCO60682 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MSCO60682 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MSCO60682 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MSCO60682 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MSCO60682 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MSCO60682 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MSCO60682 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MSCO60682 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MSCO60682 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MSCO60682 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MSCO60682 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MSCO60682 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MSCO60682 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MSCO60682 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MSCO60682 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MSCO60682 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MSCO60682 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MSCO60682 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MSCO60682 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms