Protein–RNA interactions for Protein: O43524

FOXO3, Forkhead box protein O3, humanhuman

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO3O43524 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXO3O43524 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms