Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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LRRTM2O43300 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LRRTM2O43300 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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