Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYNMO15061 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYNMO15061 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYNMO15061 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNMO15061 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNMO15061 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNMO15061 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNMO15061 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNMO15061 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNMO15061 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNMO15061 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNMO15061 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNMO15061 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNMO15061 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNMO15061 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNMO15061 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNMO15061 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNMO15061 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNMO15061 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNMO15061 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNMO15061 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNMO15061 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNMO15061 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNMO15061 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNMO15061 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNMO15061 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNMO15061 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNMO15061 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNMO15061 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNMO15061 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNMO15061 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNMO15061 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNMO15061 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNMO15061 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNMO15061 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNMO15061 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNMO15061 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNMO15061 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNMO15061 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNMO15061 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYNMO15061 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYNMO15061 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYNMO15061 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYNMO15061 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYNMO15061 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYNMO15061 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYNMO15061 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYNMO15061 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYNMO15061 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYNMO15061 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYNMO15061 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYNMO15061 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYNMO15061 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYNMO15061 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYNMO15061 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SYNMO15061 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SYNMO15061 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYNMO15061 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYNMO15061 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYNMO15061 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYNMO15061 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNMO15061 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNMO15061 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNMO15061 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNMO15061 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNMO15061 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNMO15061 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNMO15061 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNMO15061 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNMO15061 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNMO15061 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNMO15061 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNMO15061 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNMO15061 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNMO15061 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNMO15061 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNMO15061 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNMO15061 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNMO15061 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNMO15061 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNMO15061 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNMO15061 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNMO15061 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNMO15061 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNMO15061 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNMO15061 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNMO15061 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNMO15061 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNMO15061 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNMO15061 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNMO15061 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNMO15061 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNMO15061 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNMO15061 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNMO15061 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNMO15061 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNMO15061 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNMO15061 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNMO15061 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNMO15061 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms