Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOC4-APOC2K7ER74 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms