Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NPIPB9F8W1W9 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms