Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SERINC4A6NH21 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms