Protein–RNA interactions for Protein: A4D1E1

ZNF804B, Zinc finger protein 804B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF804BA4D1E1 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF804BA4D1E1 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF804BA4D1E1 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF804BA4D1E1 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF804BA4D1E1 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF804BA4D1E1 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF804BA4D1E1 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF804BA4D1E1 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF804BA4D1E1 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF804BA4D1E1 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF804BA4D1E1 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF804BA4D1E1 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF804BA4D1E1 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF804BA4D1E1 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF804BA4D1E1 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF804BA4D1E1 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF804BA4D1E1 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF804BA4D1E1 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF804BA4D1E1 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF804BA4D1E1 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF804BA4D1E1 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF804BA4D1E1 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF804BA4D1E1 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF804BA4D1E1 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF804BA4D1E1 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF804BA4D1E1 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF804BA4D1E1 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF804BA4D1E1 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF804BA4D1E1 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF804BA4D1E1 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF804BA4D1E1 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF804BA4D1E1 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF804BA4D1E1 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF804BA4D1E1 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF804BA4D1E1 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF804BA4D1E1 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF804BA4D1E1 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF804BA4D1E1 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF804BA4D1E1 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF804BA4D1E1 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF804BA4D1E1 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF804BA4D1E1 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF804BA4D1E1 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF804BA4D1E1 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF804BA4D1E1 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF804BA4D1E1 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF804BA4D1E1 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF804BA4D1E1 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF804BA4D1E1 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF804BA4D1E1 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF804BA4D1E1 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF804BA4D1E1 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF804BA4D1E1 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF804BA4D1E1 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF804BA4D1E1 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF804BA4D1E1 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF804BA4D1E1 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF804BA4D1E1 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF804BA4D1E1 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF804BA4D1E1 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF804BA4D1E1 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF804BA4D1E1 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF804BA4D1E1 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF804BA4D1E1 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF804BA4D1E1 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF804BA4D1E1 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF804BA4D1E1 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF804BA4D1E1 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF804BA4D1E1 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF804BA4D1E1 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF804BA4D1E1 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF804BA4D1E1 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF804BA4D1E1 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF804BA4D1E1 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF804BA4D1E1 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF804BA4D1E1 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF804BA4D1E1 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF804BA4D1E1 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF804BA4D1E1 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF804BA4D1E1 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF804BA4D1E1 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF804BA4D1E1 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF804BA4D1E1 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF804BA4D1E1 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNF804BA4D1E1 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF804BA4D1E1 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF804BA4D1E1 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF804BA4D1E1 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF804BA4D1E1 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF804BA4D1E1 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF804BA4D1E1 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF804BA4D1E1 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF804BA4D1E1 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF804BA4D1E1 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF804BA4D1E1 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF804BA4D1E1 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF804BA4D1E1 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF804BA4D1E1 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF804BA4D1E1 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNF804BA4D1E1 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154 ms