Protein–RNA interactions for Protein: A2RUB6

CCDC66, Coiled-coil domain-containing protein 66, humanhuman

Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC66A2RUB6 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC66A2RUB6 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC66A2RUB6 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC66A2RUB6 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC66A2RUB6 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC66A2RUB6 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC66A2RUB6 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC66A2RUB6 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC66A2RUB6 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC66A2RUB6 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC66A2RUB6 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC66A2RUB6 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC66A2RUB6 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC66A2RUB6 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC66A2RUB6 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC66A2RUB6 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC66A2RUB6 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC66A2RUB6 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC66A2RUB6 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC66A2RUB6 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC66A2RUB6 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC66A2RUB6 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC66A2RUB6 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC66A2RUB6 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC66A2RUB6 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC66A2RUB6 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC66A2RUB6 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC66A2RUB6 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC66A2RUB6 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC66A2RUB6 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC66A2RUB6 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC66A2RUB6 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC66A2RUB6 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC66A2RUB6 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC66A2RUB6 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC66A2RUB6 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC66A2RUB6 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC66A2RUB6 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC66A2RUB6 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC66A2RUB6 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC66A2RUB6 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC66A2RUB6 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC66A2RUB6 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC66A2RUB6 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC66A2RUB6 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC66A2RUB6 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC66A2RUB6 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC66A2RUB6 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC66A2RUB6 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC66A2RUB6 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC66A2RUB6 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC66A2RUB6 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC66A2RUB6 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC66A2RUB6 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC66A2RUB6 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC66A2RUB6 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC66A2RUB6 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC66A2RUB6 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC66A2RUB6 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC66A2RUB6 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC66A2RUB6 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC66A2RUB6 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC66A2RUB6 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC66A2RUB6 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC66A2RUB6 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC66A2RUB6 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC66A2RUB6 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC66A2RUB6 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC66A2RUB6 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC66A2RUB6 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC66A2RUB6 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC66A2RUB6 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC66A2RUB6 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC66A2RUB6 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC66A2RUB6 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC66A2RUB6 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC66A2RUB6 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC66A2RUB6 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC66A2RUB6 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC66A2RUB6 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC66A2RUB6 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC66A2RUB6 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC66A2RUB6 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC66A2RUB6 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC66A2RUB6 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC66A2RUB6 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC66A2RUB6 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC66A2RUB6 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC66A2RUB6 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC66A2RUB6 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC66A2RUB6 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC66A2RUB6 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC66A2RUB6 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC66A2RUB6 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC66A2RUB6 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC66A2RUB6 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC66A2RUB6 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC66A2RUB6 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC66A2RUB6 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC66A2RUB6 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms