Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4P1

ATG4B, Cysteine protease ATG4B, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4BQ9Y4P1 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATG4BQ9Y4P1 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms