Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIM35Q9UPQ4 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM35Q9UPQ4 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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