Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPA5

BSN, Protein bassoon, humanhuman

Predictions only

Length 3,926 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BSNQ9UPA5 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BSNQ9UPA5 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BSNQ9UPA5 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BSNQ9UPA5 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BSNQ9UPA5 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BSNQ9UPA5 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BSNQ9UPA5 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BSNQ9UPA5 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BSNQ9UPA5 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BSNQ9UPA5 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BSNQ9UPA5 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BSNQ9UPA5 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BSNQ9UPA5 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
BSNQ9UPA5 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BSNQ9UPA5 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BSNQ9UPA5 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BSNQ9UPA5 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BSNQ9UPA5 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BSNQ9UPA5 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BSNQ9UPA5 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BSNQ9UPA5 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BSNQ9UPA5 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BSNQ9UPA5 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
BSNQ9UPA5 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BSNQ9UPA5 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BSNQ9UPA5 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BSNQ9UPA5 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BSNQ9UPA5 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BSNQ9UPA5 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BSNQ9UPA5 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BSNQ9UPA5 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BSNQ9UPA5 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BSNQ9UPA5 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BSNQ9UPA5 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
BSNQ9UPA5 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BSNQ9UPA5 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BSNQ9UPA5 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
BSNQ9UPA5 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BSNQ9UPA5 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BSNQ9UPA5 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BSNQ9UPA5 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BSNQ9UPA5 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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