Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULS5

TMCC3, Transmembrane and coiled-coil domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCC3Q9ULS5 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCC3Q9ULS5 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms